Dans un avenir lointain, l'humanité se retrouve assiégée par une race extraterrestre redoutable appelée les Novas. Leur apparition est synonyme de chaos et de désolation, et pour lutter contre eux, des affrontements baptisés les Nova Clashes sont menés avec férocité. Les Pandoras, de jeunes femmes dotées de pouvoirs surhumains, et les Limiters, de jeunes hommes aux capacités extraordinaires, sont marqués de stigmates qui leur confèrent ces aptitudes prodigieuses. Ils sont formés dans des académies militaires, où ils apprennent à collaborer afin de redonner un semblant d'espoir à l'humanité. L'histoire de Freezing se concentre sur les péripéties de Kazuya Aoi, qui débute sa première journée à l'académie militaire de West Genetics. Cependant, tout bascule lorsque les Pandoras se lancent dans une bataille royale. C'est à ce moment précis que Kazuya confond Satellizer el Bridget, une Pandora puissante et renommée sous le nom de "Reine Intouchable", avec sa sœur décédée et l'embrasse par erreur. Bien que cet incident lui fasse perdre le combat, Satellizer découvre que le contact avec Kazuya ne la repousse pas et décide de le choisir comme son Limiter. La seule interrogation qui persiste est de savoir si leur partenariat pourra résister aux manigances de leurs camarades plus expérimentés et à l'affrontement imminent avec les Novas. La destinée de l'humanité repose entre leurs mains, mais ils devront faire face à de redoutables épreuves pour espérer sauver le monde de l'invasion extraterrestre. - Bon visionnage !